根据介绍，动画「口袋妖怪THE ORIGIN」是以口袋妖怪游戏的第一部作品「口袋妖怪红·绿」的人物为中心进行故事展开的作品，动画描写的是主角为少年小红，受大木博士委托，和搭档小火龙一起在关东地区展开大冒险，途中遇到少年小绿，并一起与火箭队战斗的故事。